Các sách biên khảo:

• "Việt Nam phong tục" (1915): nghiên cứu nghiêm túc, có tính phản biện, về thuần phong mỹ tục của Việt Nam;
• "Hán Việt văn khảo" (1918): bàn về văn chương chữ Hán ở Trung Quốc, Việt Nam và triết học Trung Quốc;
• Các sách viết về danh nhân Việt Nam: "Nam Hải dị nhân" (1909), "Hưng Đạo Đại vương" (1912).

Sách dịch thuật:

• "Đại Nam nhất thống chí" (1916);
• "Ðại nam điển lệ toát yếu" (1915 - 1916);
• "Việt Nam khai quốc chí truyện" (1917);
• "Đại Nam liệt truyện tiền biên" (1918);
• "Ðại Nam liệt truyện chỉnh biên" (1919);
• Đặc biệt là bộ "Tam quốc chí diễn nghĩa" dịch chung với Nguyễn Văn Vĩnh.

Phan Kế Bính mất lúc mới 46 tuổi vào năm Tân Dậu (1921).